当前位置:首页 > 外埠信息 > 国内 国内

中国水产科学研究院等揭示斑石鲷Y染色体起源与进化

信息来源:中国科学报  发布时间: 2021-04-20   点击数:保护视力色: 杏仁黄 秋叶褐 胭脂红 芥末绿 天蓝 雪青 灰 银河白(默认色)

斑石鲷 中国水产科学研究院供图

近日,中国水产科学研究院黄海水产研究所研究员陈松林团队联合青岛华大基因研究院、德国维尔茨堡大学等单位,在斑石鲷Y染色体起源与进化研究中取得重要进展。相关研究成果在线发表于《分子生物学与进化》。

斑石鲷是我国新兴的重要海水养殖鱼类,其味道鲜美,市场价值很高,深受消费者欢迎。斑石鲷具有复性染色体特征,其雌鱼具有22对常染色体和X1X1X2X2性染色体,而雄鱼则具有22对常染色体和X1X2Y性染色体,是研究鱼类性染色体起源与进化的理想材料。

该联合研究团队结合BGI-500、Nanopore、PacBio和Hi-C等技术,率先完成斑石鲷雌鱼和雄鱼染色体水平基因组精细图谱绘制。利用三代和重测序数据获得单倍型信息,将斑石鲷Y染色体非同源重组区进行精确组装。结构分析表明Y染色体上存在一个约23.5Mb的倒位,推测其在性别决定基因的产生和性染色体的进化过程中发挥重要作用。该研究推演了新Y(neo-Y)性染色体的起源与进化轨迹。

进化分析表明,Y染色体上新融合进来的部分在融合后才产生重组抑制,推断neo-Y的形成是原始的Y染色体与一条常染色体融合而来。同时该研究揭示了精巢和卵巢发育过程中性染色体基因的时空表达特征,鉴定了性染色体上性腺发育相关重要基因。斑石鲷neo-Y和X染色体的高质量组装,为理解复性染色体鱼类性别决定机制和性染色体的进化提供了宝贵的遗传资源。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1093/molbev/msab056