图片来源：Hamid Razifard

现在，一项由美国国家科学基金会资助的新研究，揭示并证实了南美西红柿的进化历史，相关论文发表于《分子生物学与进化》。

普通栽培番茄是世界上种植最广泛的蔬菜作物之一。2012年，驯化的亨氏1706番茄成为第一个完成全基因组测序的番茄，使人们更好地了解这种世界上价值极高的蔬菜作物。从那时起，科学家就不断加深对番茄12条染色体的进化变异的理解。

现代西红柿的起源可以追溯到南美洲。之前的研究已经提出，驯化的野生醋栗番茄在南美洲产生了圣女果。

研究人员表示，番茄驯化历史通常被描述为一个“两步”过程，从蓝莓大小的栽培番茄近缘物种（SP）到一般樱桃大小的小果型番茄（SLC），再到各地食用的普通大果型栽培番茄（SLL）。

研究人员发现，在厄瓜多尔出现的中间种群SLC远远早于人类驯化的番茄，然后随着时间的推移向北扩散。

研究人员还对SLL、SLC和SP番茄进行了全基因组测序和群体基因组学分析，以重建番茄的驯化历史。总的来说，该团队为166个样本生成了新的全基因组序列，代表了南美范围内的SP、南美和中美洲的SLC，以及来自中美洲的SLL。通过比对SLL参考基因组序列，共鉴定出23797503个单核苷酸多态性。他们还进行了广泛的表型分析，以确定现代栽培番茄与野生番茄最不同的性状。

“很明显，SLL经历了彻底的改变，而SP干重较低，有更多的小室、低水平的β—胡萝卜素和更高水平的苹果酸等。”作者说。

此外，研究人员还从SLC和SP最初的分离中得到更多令人惊讶的细节。例如，尽管南美洲的SLC群体包含许多与人类驯化品种一致的特征，但当SLC向北传播到中美洲时，这些特征就消失了。有趣的是，这些野生的北方SLC群是现代番茄的近亲。

研究人员表示，该研究可以帮助番茄种植者识别出有益基因，重新引入现代番茄品种，以改善农业和消费者所需的性状。